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动物科学系始建于1976年，
2001年全省高职高专调整后成立动物科学系，已有30年的历史,是周口职业技术学院独具办学特色的重点学科，现有畜牧兽医、饲料与动物营养、动物防疫与检疫三个专业。动物科学系一贯坚持“知名专家打造强势学科，面向市场突出办学特色，全力服务畜牧经济发展”的办学理念。坚持“依法办学，育人为本，面向市场，突出特色”的办学指导思想。主动适应市场经济对复合型高素质技术人才的需求，以培养生产、服务、经营、管理第一线需要的基础扎实、专业技术过硬、社会适应能力强并具有创新意识的一专多能的高、中级应用型人才为目标。确立“相信人人有才，教育人人成才”的培养导向，实行根据畜牧业发展和市场需要培养人，根据专业特点开设课程、强化实践训练、选定市场为真正的考场等全新的办学模式。在重视职业取向的同时，注重学生个性全面发展，不断提升学生的创新能力、实践能力和就业能力。切实达到了“来有所学，学有所成，成有所用”的目的。
动物科学系拥有一支高素质、高水平的“双师”型教师队伍，现有专业教师26人，其中博士4人，硕士生4人，在读博士生2人，在读研究生3人，教授、副教授13人，讲师6人；“全国千百人才工程”1人，享受国务院特殊津贴专家1人，河南省“优秀教师”1人，市“优秀教师”5人，“543”人才优秀青年专家、学术带头人4人，教师的年龄、学历、知识等结构合理。近年来，该系教师在全国学术刊物上发表学术论文400余篇，独著或合编教材、著作60多部，获世界科学奖1项，国家、省、市级科研成果奖87项。
动物科学系各专业教师本着“加强基础、突出主干、注重实践、全面优化”的原则，科学制定专业教学计划，为适应社会主义市场经济需要，最大限度地拓宽专业知识面，按宽口径要求设置教学课程。主干课程有：动物解剖生理学、家畜遗传繁育学、动物营养学、饲料分析与加工工艺、饲料配方与电算、饲料添加剂学、养殖学（养猪、养羊、养牛、养禽等）、特种动物养殖、畜牧业经营管理与营销、动物病理学、兽医药理学、动物微生物学、临床诊断学、动物产科与外科学、家畜传染病学、内科病学、动物疫病防治学、计算机基础、英语、等30多门课程。
动物科学系拥有实验室8个，各类仪器、设备、标本齐全，其中综合实验室设备先进，堪称一流。校内并有养殖场、兽医院、改良站和校外教学实习和就业基地：荷兰彼得汉（南宁）公司、北京伟嘉集团、江西正邦集团、广安集团、天津艾森生物工程公司、河南粤禽食品发展有限公司、金丝猴集团、双汇集团、北许集团、郑州种猪育种中心、河南丰源饲料科技发展有限公司、商丘市华康药业有限公司等。
动物科学系高度重视毕业生就业工作，通过学科与企业合作，努力打造就业服务平台，积极推行“双证”制，学生在校期间可获取“高级疫病防治员”、“高级动物检疫员”、“高级饲料化验员”、“高级动物饲养员”等国家执业技能等级证书，为毕业生就业开辟了一条绿色通道。由于该系毕业生综合素质高，实践能力强，就业面宽，社会需求量大，与省内外多家知名企业建立了比较稳定的专业人才供求关系，就业率100%，深受用人单位欢迎。多年来，动物科学系学生毕业前就被国内知名大企业、单位“抢购”一空，人才供需比例长期保持在1：12的水平，遍布全国，供不应求。
动物科学系优秀毕业生经系推荐学院批准、参加省专升本统一考试合格后，可直接升入华中农业大学、西北农林科技大学、郑州大学、河南科技大学、河南农业大学、河南大学等院校学习
，毕业后，享受普通高校本科毕业生待遇。
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